医院医务人员应严格执行无菌卫生通过医药洁净室，并应严格执行无菌技术操作规范制度。一般医院无尘室建设维护工艺流程是，医务人员在非洁净区换鞋、更换衣服后，在清洁完整戴好手套后进入洁净区，医护人员处理完成事情后应原路退出医药洁净室。其环境须是无尘、无菌的，有特殊要求的还须在指定的恒温恒湿环境下进行。
医院的所有物品应在供应集中点统一处理后，通过密闭转运或专用洁净通道进入医药无尘室洁净区，并应在洁净区无菌储存，应按需要送入。病人从非洁净区进入后，应在洁净区换洁净车辆或清洁车辆，并应在洁净区进行，结束后退出洁净室至病房或ICU。
可重复使用的器械应在集中供应点密闭式回收，并应在去污区进行清点、分类、清洗、干燥、检查和包装，灭除后的复用器械应送入无菌储存间，并应按要求储存备用。可重复使用的布类可用物品，应在洗衣房密闭式回收，并应清洗、集中送回供应点进行检查、包装和作灭除处理后，应送入无菌储存间，并应按要求储存备用。
医院无尘室建设的洁净区主体结构，不宜采用内墙承重，建议设置人员净化、物料净化设施，并应根据需要设置生活用室和其他用室。人员净化用室应包括雨具存放间、管理室、换鞋室、存外衣室、洁净工作服室和风淋室等。厕所、淋浴室、休息室等生活用室以及工作服清洗间和干燥间等其他用室，可根据建设方实际需要设置。
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